Prinsip Lembaga
Yapkema bekerja berlandaskan pada prinsip independensi, non partisan, transparansi, nirlaba dan kerelawanan.
Landasan nilai kerja
Nilai-nilai kerja Yapkema adalah anti diskriminasi, penghormatan terhadap HAM, keberpihakan pada masyarakat marginal, mengutamakan kemandirian masyarakat serta keadilan gender.